Có thể nói, những kết quả đạt được trong công tác tìm kiếm, quy tập hài cốt liệt sĩ và xác định hài cốt liệt sĩ còn thiếu thông tin đã thể hiện sự tri ân sâu sắc, công lao to lớn đối với các anh hùng liệt sĩ; sự đồng thuận của toàn xã hội và đáp ứng một phần nguyện vọng của thân nhân, gia đình liệt sĩ, góp phần củng cố niềm tin của nhân dân đối với Đảng, Nhà nước và quân đội, tạo sự ổn định chính trị - xã hội tại địa phương. Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện vẫn còn một số khó khăn đó là: Thời gian liệt sĩ hy sinh đã lâu nên mẫu hài cốt chuyển giám định bị phân hủy, nhiều trường hợp phải lấy mẫu từ 2 đến 3 lần ảnh hưởng đến phần mộ của liệt sĩ, tỷ lệ khớp nối thông qua giám định ADN rất thấp; Nhiều trường hợp hài cốt liệt sĩ không còn thân nhân để lấy mẫu phân tích ADN; Mộ liệt sĩ trong các nghĩa trang liệt sĩ được quy tập, di dời nhiều lần, hồ sơ không còn gây nhiều khó khăn cho quá trình phân tích ADN.